Molecular genetic variability, population structure and mating system in tropical forages

Authors

  • Melissa Garcia Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil.
  • Bianca B.Z. Vigna Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil.
  • Adna C.B. Sousa Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil.
  • Letícia Jungmann Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Gado de Corte, Campo Grande, MS, Brazil.
  • Fernanda W. Cidade Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil.
  • Guilherme Toledo-Silva Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil.
  • Patricia M. Francisco Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil.
  • Lucimara Chiari Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Gado de Corte, Campo Grande, MS, Brazil.
  • Marcelo A. Carvalho Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Cerrados, Planaltina, DF, Brazil.
  • Claudio T. Karia Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Cerrados, Planaltina, DF, Brazil.
  • Fabio G. Faleiro Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Cerrados, Planaltina, DF, Brazil.
  • Rodolfo Godoy Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brazil.
  • M. Dall’Agnol Faculdade de Agronomia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, RS, Brazil.
  • Sueli S. Pagliarini Centro de Ciências Biológicas, Universidade Estadual de Maringá (UEM), Maringá, PR, Brazil.
  • Francisco H.D. Souza Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP, Brazil.
  • Tatiana T. Souza-Chies Departamento de Botânica, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS), Porto Alegre, RS, Brazil.
  • Liana Jank Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Gado de Corte, Campo Grande, MS, Brazil.
  • Rosangela M.S. Resende Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Gado de Corte, Campo Grande, MS, Brazil.
  • Cacilda B. do Valle Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária, Embrapa Gado de Corte, Campo Grande, MS, Brazil.
  • Maria I. Zucchi Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA), Pólo Regional Centro Sul, Piracicaba, SP, Brazil.
  • Anete P. Souza Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campinas, SP, Brazil. Departamento de Biologia Vegetal, Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Campi-nas, SP, Brazil.

DOI:

https://doi.org/10.17138/tgft(1)25-30

Abstract

Microsatellite (SSR) markers were developed for the following tropical forage species, using accessions available from the plant genetic resources (PGR) collections held by EMBRAPA (Brazilian Agricultural Research Corporation): Brachiaria brizantha, B. humidicola, Panicum maximum, Paspalum spp., Stylosanthes capitata, S. guianensis, S. macrocephala, Calopogonium mucunoides and Centrosema spp. The markers were used to analyze population structure and genetic diversity, evolution and origin of the genetic variability in the center of origin, mating systems and genetic resources in EMBRAPA’s germplasm bank. The results shed light on the amount of genetic variation within and between populations, revealed the need in some cases for further plant collection to adequately represent the species in PGR collections, allowed us to assemble core collections (subsets of the total collections) that should contain most of the available diversity and (in the case of the legumes) showed the need to avoid unwanted outcrossing when regenerating conserved material. The data will allow plant breeders to better select accessions for hybrid production, discriminate between genotypes and use marker-assisted selection in breeding programs. Our results will also underpin the construction of genetic maps, mapping of genes of agronomic interest and numerous other studies on genetic variability, population structure, gene flow and reproductive systems for the tropical forage species studied in this work.

How to Cite

Garcia, M., Vigna, B. B., Sousa, A. C., Jungmann, L., Cidade, F. W., Toledo-Silva, G., Francisco, P. M., Chiari, L., Carvalho, M. A., Karia, C. T., Faleiro, F. G., Godoy, R., Dall’Agnol, M., Pagliarini, S. S., Souza, F. H., Souza-Chies, T. T., Jank, L., Resende, R. M., do Valle, C. B., Zucchi, M. I., & Souza, A. P. (2013). Molecular genetic variability, population structure and mating system in tropical forages. Tropical Grasslands-Forrajes Tropicales, 1(1), 25–30. https://doi.org/10.17138/tgft(1)25-30

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Published

2013-09-15

Issue

Section

IGC 2013 Oral Presentation Papers